Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pde12Q3TIU4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde12Q3TIU4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde12Q3TIU4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pde12Q3TIU4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pde12Q3TIU4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms