Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2afvQ3THW5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2afvQ3THW5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2afvQ3THW5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms