Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccbe1Q3MI99 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccbe1Q3MI99 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms