Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Spatc1Q148B6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spatc1Q148B6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Spatc1Q148B6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Spatc1Q148B6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spatc1Q148B6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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