Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gli2Q0VGT2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Gli2Q0VGT2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Gli2Q0VGT2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Gli2Q0VGT2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Gli2Q0VGT2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms