Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hif3aQ0VBL6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hif3aQ0VBL6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Hif3aQ0VBL6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms