Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SobpQ0P5V2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SobpQ0P5V2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SobpQ0P5V2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SobpQ0P5V2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SobpQ0P5V2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SobpQ0P5V2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms