Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Spata18Q0P557 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Spata18Q0P557 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Spata18Q0P557 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Spata18Q0P557 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Spata18Q0P557 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Spata18Q0P557 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Spata18Q0P557 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26,68■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Spata18Q0P557 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26,63■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Spata18Q0P557 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms