Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gata4Q08369 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gata4Q08369 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms