Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cab39Q06138 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cab39Q06138 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39Q06138 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms