Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sox9Q04887 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox9Q04887 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox9Q04887 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms