Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nf1Q04690 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nf1Q04690 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nf1Q04690 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.9 ms