Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnb1Q03717 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnb1Q03717 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kcnb1Q03717 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms