Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cacna1sQ02789 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cacna1sQ02789 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cacna1sQ02789 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cacna1sQ02789 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cacna1sQ02789 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cacna1sQ02789 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cacna1sQ02789 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cacna1sQ02789 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cacna1sQ02789 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cacna1sQ02789 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms