Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhlh1Q02576 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nhlh1Q02576 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nhlh1Q02576 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.8 ms