Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zfp39Q02525 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zfp39Q02525 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Zfp39Q02525 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Zfp39Q02525 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zfp39Q02525 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zfp39Q02525 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Zfp39Q02525 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Zfp39Q02525 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp39Q02525 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms