Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VcpQ01853 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VcpQ01853 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VcpQ01853 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VcpQ01853 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VcpQ01853 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VcpQ01853 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VcpQ01853 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VcpQ01853 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VcpQ01853 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VcpQ01853 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VcpQ01853 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VcpQ01853 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VcpQ01853 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VcpQ01853 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VcpQ01853 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms