Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cacna1cQ01815 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1cQ01815 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1cQ01815 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms