Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SelpQ01102 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SelpQ01102 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SelpQ01102 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SelpQ01102 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SelpQ01102 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SelpQ01102 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SelpQ01102 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SelpQ01102 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SelpQ01102 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SelpQ01102 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms