Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms