Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrcdQ00LT2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms