Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brca2P97929 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brca2P97929 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca2P97929 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca2P97929 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca2P97929 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brca2P97929 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brca2P97929 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca2P97929 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca2P97929 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca2P97929 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Brca2P97929 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca2P97929 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca2P97929 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca2P97929 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca2P97929 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brca2P97929 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms