Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lama4P97927 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lama4P97927 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lama4P97927 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lama4P97927 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lama4P97927 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lama4P97927 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lama4P97927 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lama4P97927 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lama4P97927 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lama4P97927 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lama4P97927 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lama4P97927 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama4P97927 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama4P97927 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lama4P97927 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lama4P97927 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lama4P97927 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lama4P97927 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lama4P97927 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lama4P97927 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lama4P97927 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lama4P97927 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama4P97927 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lama4P97927 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lama4P97927 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lama4P97927 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lama4P97927 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lama4P97927 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms