Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh6P97326 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh6P97326 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh6P97326 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh6P97326 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh6P97326 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh6P97326 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh6P97326 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh6P97326 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh6P97326 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh6P97326 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdh6P97326 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh6P97326 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms