Protein–RNA interactions for Protein: P80315

Cct4, T-complex protein 1 subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct4P80315 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cct4P80315 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cct4P80315 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cct4P80315 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cct4P80315 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cct4P80315 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cct4P80315 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cct4P80315 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cct4P80315 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cct4P80315 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cct4P80315 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cct4P80315 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cct4P80315 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cct4P80315 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cct4P80315 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cct4P80315 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cct4P80315 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cct4P80315 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cct4P80315 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cct4P80315 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cct4P80315 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cct4P80315 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cct4P80315 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms