Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ldb1P70662 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldb1P70662 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldb1P70662 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms