Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrig1P70193 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig1P70193 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig1P70193 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrig1P70193 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig1P70193 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig1P70193 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig1P70193 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig1P70193 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig1P70193 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig1P70193 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig1P70193 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig1P70193 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig1P70193 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig1P70193 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig1P70193 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig1P70193 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig1P70193 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrig1P70193 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig1P70193 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig1P70193 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig1P70193 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms