Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn5P68500 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn5P68500 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn5P68500 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms