Protein–RNA interactions for Protein: P63054

Pcp4, Calmodulin regulator protein PCP4, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4P63054 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15,47■□□□□ 0,07
Pcp4P63054 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Pcp4P63054 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Pcp4P63054 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Pcp4P63054 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Pcp4P63054 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Pcp4P63054 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Pcp4P63054 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15,45■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15,44■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,44■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15,43■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,41■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,41■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,41■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,41■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,41■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,41■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pcp4P63054 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15,35■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15,35■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15,35■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pcp4P63054 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15,33■□□□□ 0,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,6 ms