Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf6P62331 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf6P62331 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf6P62331 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf6P62331 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf6P62331 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arf6P62331 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms