Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp46P62069 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp46P62069 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp46P62069 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp46P62069 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp46P62069 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp46P62069 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp46P62069 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp46P62069 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp46P62069 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp46P62069 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp46P62069 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp46P62069 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp46P62069 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms