Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Wdhd1P59328 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Wdhd1P59328 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Wdhd1P59328 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Wdhd1P59328 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms