Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Vps33bP59016 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Vps33bP59016 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Vps33bP59016 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps33bP59016 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Vps33bP59016 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Vps33bP59016 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vps33bP59016 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms