Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Uchl4P58321 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uchl4P58321 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uchl4P58321 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms