Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dpf3P58269 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dpf3P58269 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dpf3P58269 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dpf3P58269 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms