Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn4P57780 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn4P57780 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn4P57780 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Actn4P57780 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn4P57780 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn4P57780 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn4P57780 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn4P57780 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn4P57780 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn4P57780 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn4P57780 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn4P57780 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Actn4P57780 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Actn4P57780 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Actn4P57780 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Actn4P57780 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Actn4P57780 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Actn4P57780 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Actn4P57780 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn4P57780 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn4P57780 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn4P57780 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn4P57780 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn4P57780 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn4P57780 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms