Protein–RNA interactions for Protein: P56567

Csta, Cystatin-A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CstaP56567 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CstaP56567 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CstaP56567 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CstaP56567 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CstaP56567 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CstaP56567 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CstaP56567 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CstaP56567 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CstaP56567 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CstaP56567 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CstaP56567 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CstaP56567 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CstaP56567 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CstaP56567 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CstaP56567 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CstaP56567 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CstaP56567 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CstaP56567 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CstaP56567 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CstaP56567 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CstaP56567 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CstaP56567 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CstaP56567 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CstaP56567 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CstaP56567 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CstaP56567 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CstaP56567 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CstaP56567 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CstaP56567 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CstaP56567 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CstaP56567 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CstaP56567 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CstaP56567 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CstaP56567 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CstaP56567 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CstaP56567 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CstaP56567 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CstaP56567 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CstaP56567 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CstaP56567 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CstaP56567 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CstaP56567 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CstaP56567 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CstaP56567 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CstaP56567 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CstaP56567 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CstaP56567 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CstaP56567 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CstaP56567 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CstaP56567 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CstaP56567 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CstaP56567 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CstaP56567 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CstaP56567 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CstaP56567 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CstaP56567 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CstaP56567 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CstaP56567 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CstaP56567 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CstaP56567 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CstaP56567 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CstaP56567 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CstaP56567 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CstaP56567 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CstaP56567 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CstaP56567 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CstaP56567 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CstaP56567 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CstaP56567 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CstaP56567 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CstaP56567 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CstaP56567 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CstaP56567 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CstaP56567 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CstaP56567 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CstaP56567 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CstaP56567 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CstaP56567 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CstaP56567 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CstaP56567 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CstaP56567 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CstaP56567 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CstaP56567 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CstaP56567 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CstaP56567 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CstaP56567 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CstaP56567 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CstaP56567 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CstaP56567 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CstaP56567 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CstaP56567 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CstaP56567 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CstaP56567 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CstaP56567 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CstaP56567 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CstaP56567 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CstaP56567 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CstaP56567 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CstaP56567 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CstaP56567 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms