Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Faf1P54731 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Faf1P54731 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Faf1P54731 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Faf1P54731 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Faf1P54731 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Faf1P54731 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Faf1P54731 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Faf1P54731 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Faf1P54731 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Faf1P54731 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms