Protein–RNA interactions for Protein: P53668

Limk1, LIM domain kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk1P53668 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Limk1P53668 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Limk1P53668 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Limk1P53668 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limk1P53668 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Limk1P53668 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limk1P53668 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk1P53668 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Limk1P53668 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Limk1P53668 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limk1P53668 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limk1P53668 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limk1P53668 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limk1P53668 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limk1P53668 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limk1P53668 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms