Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pold1P52431 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pold1P52431 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pold1P52431 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pold1P52431 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pold1P52431 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pold1P52431 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pold1P52431 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pold1P52431 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pold1P52431 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pold1P52431 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pold1P52431 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pold1P52431 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pold1P52431 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pold1P52431 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pold1P52431 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pold1P52431 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pold1P52431 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pold1P52431 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pold1P52431 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pold1P52431 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pold1P52431 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pold1P52431 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms