Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SqleP52019 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SqleP52019 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SqleP52019 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SqleP52019 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SqleP52019 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SqleP52019 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SqleP52019 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SqleP52019 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SqleP52019 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SqleP52019 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SqleP52019 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SqleP52019 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SqleP52019 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SqleP52019 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SqleP52019 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SqleP52019 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SqleP52019 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SqleP52019 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SqleP52019 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SqleP52019 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SqleP52019 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SqleP52019 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SqleP52019 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SqleP52019 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SqleP52019 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SqleP52019 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SqleP52019 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SqleP52019 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SqleP52019 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SqleP52019 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SqleP52019 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SqleP52019 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SqleP52019 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SqleP52019 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SqleP52019 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SqleP52019 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SqleP52019 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SqleP52019 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SqleP52019 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SqleP52019 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SqleP52019 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SqleP52019 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SqleP52019 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SqleP52019 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SqleP52019 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SqleP52019 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SqleP52019 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SqleP52019 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SqleP52019 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SqleP52019 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SqleP52019 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SqleP52019 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SqleP52019 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SqleP52019 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SqleP52019 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SqleP52019 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SqleP52019 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SqleP52019 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SqleP52019 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SqleP52019 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SqleP52019 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SqleP52019 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SqleP52019 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SqleP52019 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SqleP52019 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SqleP52019 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SqleP52019 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SqleP52019 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SqleP52019 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SqleP52019 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SqleP52019 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SqleP52019 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SqleP52019 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SqleP52019 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SqleP52019 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SqleP52019 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SqleP52019 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SqleP52019 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SqleP52019 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SqleP52019 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SqleP52019 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SqleP52019 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SqleP52019 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SqleP52019 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SqleP52019 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SqleP52019 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SqleP52019 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SqleP52019 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SqleP52019 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SqleP52019 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SqleP52019 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SqleP52019 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SqleP52019 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SqleP52019 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SqleP52019 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SqleP52019 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SqleP52019 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SqleP52019 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SqleP52019 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms