Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc1a1P51906 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc1a1P51906 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc1a1P51906 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc1a1P51906 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms