Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clcn3P51791 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clcn3P51791 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcn3P51791 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcn3P51791 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn3P51791 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn3P51791 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn3P51791 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn3P51791 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clcn3P51791 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clcn3P51791 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn3P51791 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clcn3P51791 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms