Protein–RNA interactions for Protein: P50713

Defa15, Alpha-defensin 15, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa15P50713 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa15P50713 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa15P50713 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa15P50713 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa15P50713 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa15P50713 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa15P50713 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa15P50713 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa15P50713 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa15P50713 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa15P50713 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa15P50713 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa15P50713 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa15P50713 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa15P50713 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa15P50713 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa15P50713 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa15P50713 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa15P50713 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa15P50713 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa15P50713 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa15P50713 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa15P50713 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa15P50713 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa15P50713 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa15P50713 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa15P50713 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms