Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CitP49025 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CitP49025 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CitP49025 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CitP49025 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CitP49025 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CitP49025 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CitP49025 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CitP49025 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CitP49025 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CitP49025 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CitP49025 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CitP49025 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CitP49025 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CitP49025 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CitP49025 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CitP49025 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CitP49025 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CitP49025 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CitP49025 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CitP49025 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CitP49025 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CitP49025 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CitP49025 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CitP49025 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CitP49025 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CitP49025 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CitP49025 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CitP49025 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CitP49025 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CitP49025 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CitP49025 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CitP49025 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CitP49025 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CitP49025 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CitP49025 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CitP49025 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CitP49025 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CitP49025 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CitP49025 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CitP49025 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CitP49025 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CitP49025 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CitP49025 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CitP49025 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CitP49025 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CitP49025 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CitP49025 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CitP49025 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CitP49025 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CitP49025 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CitP49025 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CitP49025 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CitP49025 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CitP49025 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CitP49025 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CitP49025 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CitP49025 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CitP49025 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CitP49025 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CitP49025 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CitP49025 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CitP49025 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CitP49025 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CitP49025 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CitP49025 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CitP49025 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CitP49025 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CitP49025 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CitP49025 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CitP49025 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CitP49025 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CitP49025 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CitP49025 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CitP49025 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CitP49025 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CitP49025 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CitP49025 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CitP49025 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CitP49025 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CitP49025 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CitP49025 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CitP49025 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CitP49025 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CitP49025 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CitP49025 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CitP49025 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CitP49025 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CitP49025 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CitP49025 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CitP49025 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CitP49025 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CitP49025 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CitP49025 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CitP49025 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CitP49025 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CitP49025 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CitP49025 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CitP49025 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CitP49025 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms