Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atoh1P48985 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atoh1P48985 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atoh1P48985 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atoh1P48985 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atoh1P48985 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atoh1P48985 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atoh1P48985 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atoh1P48985 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Atoh1P48985 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atoh1P48985 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atoh1P48985 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atoh1P48985 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atoh1P48985 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atoh1P48985 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms