Protein–RNA interactions for Protein: P48722

Hspa4l, Heat shock 70 kDa protein 4L, mousemouse

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa4lP48722 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hspa4lP48722 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hspa4lP48722 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hspa4lP48722 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms