Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg3P47867 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg3P47867 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg3P47867 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg3P47867 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg3P47867 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg3P47867 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scg3P47867 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scg3P47867 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scg3P47867 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scg3P47867 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scg3P47867 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scg3P47867 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg3P47867 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg3P47867 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg3P47867 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg3P47867 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg3P47867 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scg3P47867 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg3P47867 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scg3P47867 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scg3P47867 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scg3P47867 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scg3P47867 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scg3P47867 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scg3P47867 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms