Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syt1P46096 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syt1P46096 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syt1P46096 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syt1P46096 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syt1P46096 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syt1P46096 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syt1P46096 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syt1P46096 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syt1P46096 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syt1P46096 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syt1P46096 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syt1P46096 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Syt1P46096 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syt1P46096 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syt1P46096 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Syt1P46096 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Syt1P46096 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syt1P46096 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syt1P46096 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syt1P46096 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syt1P46096 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syt1P46096 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Syt1P46096 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syt1P46096 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syt1P46096 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syt1P46096 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syt1P46096 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syt1P46096 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syt1P46096 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syt1P46096 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms