Protein–RNA interactions for Protein: P43352

Rad52, DNA repair protein RAD52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad52P43352 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad52P43352 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad52P43352 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad52P43352 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad52P43352 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad52P43352 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rad52P43352 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rad52P43352 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad52P43352 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rad52P43352 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad52P43352 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad52P43352 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad52P43352 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad52P43352 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad52P43352 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad52P43352 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rad52P43352 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad52P43352 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad52P43352 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad52P43352 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad52P43352 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad52P43352 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad52P43352 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad52P43352 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad52P43352 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad52P43352 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad52P43352 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad52P43352 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad52P43352 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad52P43352 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms